Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prex1Q69ZK0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Prex1Q69ZK0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prex1Q69ZK0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prex1Q69ZK0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prex1Q69ZK0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prex1Q69ZK0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prex1Q69ZK0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prex1Q69ZK0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prex1Q69ZK0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prex1Q69ZK0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms