Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Top2bQ64511 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Top2bQ64511 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Top2bQ64511 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms