Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja3Q64448 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja3Q64448 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja3Q64448 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja3Q64448 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja3Q64448 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja3Q64448 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja3Q64448 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja3Q64448 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja3Q64448 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja3Q64448 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja3Q64448 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gja3Q64448 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gja3Q64448 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms