Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt12Q64291 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms