Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifit1Q64282 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit1Q64282 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms