Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms