Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CochQ62507 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CochQ62507 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CochQ62507 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CochQ62507 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CochQ62507 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CochQ62507 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CochQ62507 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CochQ62507 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CochQ62507 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CochQ62507 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CochQ62507 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CochQ62507 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CochQ62507 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CochQ62507 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CochQ62507 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CochQ62507 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CochQ62507 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CochQ62507 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CochQ62507 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CochQ62507 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CochQ62507 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CochQ62507 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CochQ62507 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CochQ62507 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CochQ62507 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CochQ62507 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CochQ62507 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CochQ62507 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CochQ62507 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CochQ62507 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CochQ62507 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CochQ62507 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CochQ62507 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CochQ62507 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CochQ62507 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CochQ62507 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CochQ62507 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CochQ62507 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CochQ62507 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CochQ62507 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CochQ62507 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CochQ62507 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CochQ62507 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CochQ62507 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CochQ62507 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CochQ62507 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CochQ62507 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CochQ62507 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CochQ62507 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CochQ62507 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CochQ62507 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CochQ62507 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CochQ62507 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CochQ62507 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CochQ62507 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CochQ62507 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CochQ62507 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CochQ62507 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CochQ62507 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CochQ62507 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CochQ62507 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms