Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vil1Q62468 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms