Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm20865Q62460 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm20865Q62460 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm20865Q62460 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm20865Q62460 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm20865Q62460 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm20865Q62460 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm20865Q62460 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm20865Q62460 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm20865Q62460 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm20865Q62460 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm20865Q62460 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20865Q62460 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20865Q62460 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm20865Q62460 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms