Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spock1Q62288 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Spock1Q62288 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spock1Q62288 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spock1Q62288 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spock1Q62288 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spock1Q62288 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spock1Q62288 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spock1Q62288 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spock1Q62288 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spock1Q62288 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spock1Q62288 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms