Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a2Q62203 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a2Q62203 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms