Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm38Q62176 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm38Q62176 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms