Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sin3bQ62141 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3bQ62141 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms