Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AtrxQ61687 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AtrxQ61687 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms