Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gli3Q61602 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gli3Q61602 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gli3Q61602 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms