Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tfap2bQ61313 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tfap2bQ61313 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms