Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ift20Q61025 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ift20Q61025 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms