Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kpna1Q60960 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kpna1Q60960 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms