Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbibQ60778 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbibQ60778 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbibQ60778 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms