Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mkrn3Q60764 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mkrn3Q60764 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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