Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nr2f1Q60632 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms