Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG73

Acbd5, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd5Q5XG73 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Acbd5Q5XG73 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acbd5Q5XG73 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Acbd5Q5XG73 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Acbd5Q5XG73 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Acbd5Q5XG73 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acbd5Q5XG73 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Acbd5Q5XG73 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms