Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tdrd5Q5VCS6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Tdrd5Q5VCS6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tdrd5Q5VCS6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms