Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms