Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Specc1Q5SXY1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Specc1Q5SXY1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms