Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med13Q5SWW4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms