Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NacadQ5SWP3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NacadQ5SWP3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NacadQ5SWP3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NacadQ5SWP3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms