Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsr1Q5SWD9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsr1Q5SWD9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms