Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mks1Q5SW45 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms