Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam46cQ5SSF7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam46cQ5SSF7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms