Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps54Q5SPW0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms