Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf12Q5SPL2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf12Q5SPL2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms