Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r209Q5NC97 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r209Q5NC97 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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