Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
1810065E05RikQ5NC41 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1810065E05RikQ5NC41 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms