Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf2Q5NC05 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf2Q5NC05 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf2Q5NC05 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms