Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps41Q5KU39 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps41Q5KU39 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms