Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2f8Q58FA4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f8Q58FA4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms