Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prune2Q52KR3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prune2Q52KR3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms