Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srrm1Q52KI8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srrm1Q52KI8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms