Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccnl1Q52KE7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccnl1Q52KE7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms