Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD9

Nxf3, Nuclear RNA export factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf3Q4ZGD9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nxf3Q4ZGD9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nxf3Q4ZGD9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms