Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf109Q499E6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C1orf109Q499E6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms