Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Brinp3Q499E0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brinp3Q499E0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Brinp3Q499E0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms