Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxn3Q499D0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms