Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samt2Q497M0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt2Q497M0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samt2Q497M0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms