Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clul1Q3ZRW6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clul1Q3ZRW6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms