Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Krtap1-4Q3V2D6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Krtap1-4Q3V2D6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms