Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
B230104I21RikQ3USW4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
B230104I21RikQ3USW4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B230104I21RikQ3USW4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms