Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm28047Q3US59 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28047Q3US59 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms