Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D13Ertd608eQ3UPR8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms